Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms