Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DA42 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DA42 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DA42 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DA42 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DA42 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DA42 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DA42 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DA42 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DA42 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DA42 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DA42 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DA42 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DA42 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DA42 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DA42 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DA42 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DA42 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DA42 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DA42 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DA42 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DA42 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DA42 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DA42 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DA42 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DA42 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9DA42 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9DA42 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9DA42 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9DA42 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9DA42 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9DA42 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9DA42 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9DA42 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9DA42 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9DA42 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9DA42 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9DA42 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9DA42 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9DA42 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9DA42 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9DA42 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9DA42 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DA42 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DA42 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DA42 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DA42 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DA42 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DA42 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DA42 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DA42 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DA42 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DA42 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DA42 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DA42 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DA42 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DA42 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DA42 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DA42 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DA42 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DA42 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DA42 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DA42 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DA42 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DA42 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DA42 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DA42 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DA42 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DA42 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DA42 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DA42 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DA42 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DA42 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DA42 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DA42 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DA42 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DA42 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DA42 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DA42 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DA42 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DA42 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DA42 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DA42 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DA42 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DA42 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DA42 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DA42 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DA42 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DA42 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DA42 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DA42 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DA42 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DA42 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DA42 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DA42 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DA42 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DA42 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DA42 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DA42 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DA42 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms