Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
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Usp12Q9D9M2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Usp12Q9D9M2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms