Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9L5

Actrt2, Actin-related protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt2Q9D9L5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt2Q9D9L5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms