Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9H8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9H8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9H8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9H8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D9H8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D9H8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9H8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9H8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9H8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms