Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmco5aQ9D9D5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms