Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms