Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg7Q9D906 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms