Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms