Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8W5

Psmd12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd12Q9D8W5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd12Q9D8W5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd12Q9D8W5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd12Q9D8W5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd12Q9D8W5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd12Q9D8W5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd12Q9D8W5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd12Q9D8W5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd12Q9D8W5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd12Q9D8W5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd12Q9D8W5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd12Q9D8W5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd12Q9D8W5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd12Q9D8W5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms