Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms