Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms