Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tmem54Q9D7S1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Tmem54Q9D7S1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Tmem54Q9D7S1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Tmem54Q9D7S1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Tmem54Q9D7S1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Tmem54Q9D7S1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Tmem54Q9D7S1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Tmem54Q9D7S1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Tmem54Q9D7S1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Tmem54Q9D7S1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Tmem54Q9D7S1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Tmem54Q9D7S1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Tmem54Q9D7S1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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