Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms