Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms