Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms