Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra4Q9D6F4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms