Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc39Q9D5Y1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc39Q9D5Y1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc39Q9D5Y1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc39Q9D5Y1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc39Q9D5Y1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc39Q9D5Y1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms