Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms