Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms