Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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