Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam227bQ9D518 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms