Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrameQ9D4Z5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms