Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D4W2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D4W2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D4W2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D4W2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms