Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh2Q9D489 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms