Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UvssaQ9D479 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms