Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pus10Q9D3U0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms