Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rnf128Q9D304 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf128Q9D304 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rnf128Q9D304 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf128Q9D304 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf128Q9D304 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf128Q9D304 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rnf128Q9D304 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf128Q9D304 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rnf128Q9D304 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rnf128Q9D304 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf128Q9D304 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rnf128Q9D304 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rnf128Q9D304 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rnf128Q9D304 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf128Q9D304 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf128Q9D304 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rnf128Q9D304 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rnf128Q9D304 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rnf128Q9D304 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf128Q9D304 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf128Q9D304 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf128Q9D304 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf128Q9D304 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf128Q9D304 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf128Q9D304 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf128Q9D304 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf128Q9D304 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf128Q9D304 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf128Q9D304 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf128Q9D304 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf128Q9D304 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf128Q9D304 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf128Q9D304 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf128Q9D304 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf128Q9D304 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rnf128Q9D304 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms