Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms