Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tmed11Q9D2R4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tmed11Q9D2R4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tmed11Q9D2R4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tmed11Q9D2R4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tmed11Q9D2R4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tmed11Q9D2R4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tmed11Q9D2R4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tmed11Q9D2R4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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