Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms