Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Creb3l4Q9D2A5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms