Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Spns3Q9D232 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms