Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H6

Ndufaf4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf4Q9D1H6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf4Q9D1H6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ndufaf4Q9D1H6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ndufaf4Q9D1H6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ndufaf4Q9D1H6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ndufaf4Q9D1H6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ndufaf4Q9D1H6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ndufaf4Q9D1H6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf4Q9D1H6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf4Q9D1H6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms