Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N7

Chaf1b, Chromatin assembly factor 1 subunit B, mousemouse

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1bQ9D0N7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chaf1bQ9D0N7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chaf1bQ9D0N7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chaf1bQ9D0N7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chaf1bQ9D0N7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chaf1bQ9D0N7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chaf1bQ9D0N7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chaf1bQ9D0N7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chaf1bQ9D0N7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chaf1bQ9D0N7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chaf1bQ9D0N7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chaf1bQ9D0N7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chaf1bQ9D0N7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chaf1bQ9D0N7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chaf1bQ9D0N7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chaf1bQ9D0N7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chaf1bQ9D0N7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chaf1bQ9D0N7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chaf1bQ9D0N7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chaf1bQ9D0N7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chaf1bQ9D0N7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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