Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms