Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms