Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ04

Cops7a, COP9 signalosome complex subunit 7a, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7aQ9CZ04 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops7aQ9CZ04 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms