Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Bud23Q9CY21 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Bud23Q9CY21 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Bud23Q9CY21 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Bud23Q9CY21 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Bud23Q9CY21 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Bud23Q9CY21 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Bud23Q9CY21 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Bud23Q9CY21 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Bud23Q9CY21 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Bud23Q9CY21 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Bud23Q9CY21 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Bud23Q9CY21 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Bud23Q9CY21 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Bud23Q9CY21 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Bud23Q9CY21 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Bud23Q9CY21 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Bud23Q9CY21 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Bud23Q9CY21 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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