Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl11Q9CXW4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms