Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms