Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd8Q9CX56 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmd8Q9CX56 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmd8Q9CX56 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmd8Q9CX56 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmd8Q9CX56 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmd8Q9CX56 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms