Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms