Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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