Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms