Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms