Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NubplQ9CWD8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.08■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms