Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Atxn3Q9CVD2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms