Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms