Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dis3Q9CSH3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dis3Q9CSH3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms